| Kary Mullis博士也許并沒有想到,他的PCR技術能夠在未來三十年保持長盛不衰。這不僅要歸功于DNA聚合酶的發(fā)展,也要歸功于PCR儀的不斷升級。如今,反應效率提高,反應體積減少,使得PCR逐漸應用在廣泛的領域。選購PCR儀,似乎并不是一件難事。然而,對于一些關鍵的參數(shù),你真的了解它們的意義嗎?
現(xiàn)在,快速PCR已成為一種潮流。反應時間從90分鐘縮短到30分鐘,是受歡迎的,畢竟誰也不想在預約PCR儀時排隊等太久。溫度循環(huán)是所有PCR的基礎。儀器的變溫速率將決定PCR運行的整體速度。毫無疑問,變溫越快,PCR運行也越快。宣傳資料往往也會先展示高變溫速率以暗示PCR儀運行速度快。因此,在拿到參數(shù)表時,我們時間會留意變溫速率,也就是升降溫速率。
不過,如果大家留心看,通常會發(fā)現(xiàn)ramp rate前面還會有一個Max,這說明制造商公布的是大變溫速率。大模塊變溫速率(maximum block ramp rate)表示模塊變溫速率的限峰值。在PCR運行過程中,上述大性能只在短的時間內可達到,那種掐著秒表來計算變溫速率的方法是不可取的。因此有誠意的制造商還會公布平均模塊變溫速率(average block ramp rate),表示在較長的變溫范圍內溫度變化的速率。這個參數(shù)沒那么炫目,但具參考意義,具有比較價值。
當然,樣品的變溫速率可沒有模塊那么高。這就好比在爐子上燒水,爐子很快就達到100ºC以上,但水可能只有50ºC。模塊的熱量傳遞到樣品還需要一定的滯后時間。因此,只根據(jù)模塊溫度編程而不考慮樣品體積的變溫速率并不能算準確。
Applied Biosystems在這一點上就很周道,提供了另一種參數(shù),平均樣本變溫速率(average sample ramp rate)或者大樣品變溫速率(maximum sample ramp rate)。這個參數(shù)能反應儀器根據(jù)體積來控制樣品達到設置溫度、遵循預設的實驗方案運行的真實能力,有效地評估PCR儀的真實性能。 |